Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox8Q04886 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms