Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms