Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs2Q03350 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms