Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms