Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RykQ01887 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RykQ01887 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RykQ01887 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RykQ01887 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RykQ01887 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RykQ01887 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RykQ01887 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms