Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb1Q00420 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms