Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms