Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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