Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcgP82348 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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