Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SgcdP82347 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SgcdP82347 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SgcdP82347 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SgcdP82347 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SgcdP82347 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SgcdP82347 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms