Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms