Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc8a1P70414 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc8a1P70414 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms