Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shox2P70390 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms