Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad1P70340 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms