Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms