Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NficP70255 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NficP70255 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NficP70255 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NficP70255 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms