Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Acta1P68134 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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