Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps28P62858 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps28P62858 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps28P62858 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms