Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms