Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsc22d1P62500 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d1P62500 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms