Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms