Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms