Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl1P61211 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms