Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ppfia3P60469 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms