Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms