Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp3P59055 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrnp3P59055 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms