Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms