Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rp1P56716 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rp1P56716 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms