Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms