Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CdaP56389 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CdaP56389 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CdaP56389 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CdaP56389 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CdaP56389 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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