Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfP51642 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfP51642 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfP51642 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfP51642 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfP51642 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfP51642 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfP51642 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfP51642 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfP51642 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntfP51642 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntfP51642 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms