Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TspoP50637 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TspoP50637 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TspoP50637 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TspoP50637 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TspoP50637 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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