Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms