Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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PtpreP49446 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpreP49446 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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PtpreP49446 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PtpreP49446 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PtpreP49446 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PtpreP49446 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PtpreP49446 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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PtpreP49446 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpreP49446 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms