Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp3P49194 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 435.4 ms