Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms