Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms