Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HmgclP38060 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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