Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lig1P37913 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms