Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms