Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms