Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RetP35546 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RetP35546 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RetP35546 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RetP35546 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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