Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptger1P35375 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptger1P35375 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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