Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptk2P34152 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms