Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc5P32043 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms