Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms