Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa5P28312 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms