Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms