Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BrafP28028 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BrafP28028 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BrafP28028 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BrafP28028 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BrafP28028 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BrafP28028 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms