Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vav1P27870 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vav1P27870 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms